| 1 | MB Praeities tyrimų institutas | Mažeikiai | 632 786 | −28 006 | 10 | |
| 2 | Mažeikių sutrikusios psichikos žmonių globos bendrija "Gyvenimo spalvos" | Mažeikiai | 132 467 | 0 | 3 | |
| 3 | Sutrikusio intelekto žmonių globos bendrija "Mažeikių Viltis" | Mažeikiai | 93 795 | −469 | 7 | |
| 4 | Šiaurės vakarų Lietuvos vietos veiklos grupė | Mažeikiai | 80 797 | 0 | 4 | |
| 5 | Mažeikių Rotary klubas "Liberta" | Mažeikiai | 32 125 | 0 | — | |
| 6 | Menų asociacija | Mažeikiai | 26 990 | −2 823 | 2 | |
| 7 | Mažeikių miesto vietos veiklos grupė | Mažeikiai | 18 303 | −1 056 | 2 | |
| 8 | Melioracijos sistemų naudotojų asociacija "Laisvė" | Mažeikiai | 16 382 | 0 | — | |
| 9 | Visuomeninis judėjimas "Mažeikiai KITAIP" | Mažeikiai | 11 760 | −1 176 | 1 | |
| 10 | "MAŽEIKIŲ TREČIOJO AMŽIAUS UNIVERSITETAS" | Mažeikiai | 10 137 | 10 137 | — | |
| 11 | Asociacija "Bendraukime" | Mažeikiai | 9 529 | −279 | 2 | |
| 12 | Motociklistų susivienijimas "Juodvarniai" | Mažeikiai | 9 390 | −7 239 | — | |
| 13 | Reivyčių bendruomenė | Mažeikiai | 7 107 | 0 | — | |
| 14 | Lietuvos pensininkų sąjungos "Bočiai" Mažeikių rajono bendrija | Mažeikiai | 6 217 | −294 | — | |
| 15 | Asociacija "FC Impulsas" | Mažeikiai | 4 360 | 0 | — | |
| 16 | Mažeikių bitininkų draugija | Mažeikiai | 3 347 | 310 | — | |
| 17 | MAŽEIKIŲ RAJONO JAUNIMO IR SU JAUNIMU DIRBANČIŲ VISUOMENINIŲ ORGANIZACIJŲ ASOCIACIJA "APSKRITAS STALAS" | Mažeikiai | 2 300 | 0 | — | |
| 18 | VšĮ "Revogen" | Mažeikiai | 591 | 0 | — | — |
| 19 | Mažeikių rajono išsėtinės sklerozės draugija | Mažeikiai | 557 | −10 | — | |
| 20 | Asociacija "JCI Mažeikiai" | Mažeikiai | 358 | 325 | — | — |
| 21 | Jungtinis aviamodelių sporto klubas | Mažeikiai | 325 | −41 | — | |
| 22 | Žemaitijos šunų mylėtojų klubas "AMICUS CANIS" | Mažeikiai | 300 | 140 | — | |
| 23 | Mažeikių sveikatos asociacija | Mažeikiai | 250 | 194 | — | |
| 24 | Lietuvos sergančiųjų genetinėmis nervų - raumenų ligomis asociacija "Sraunija" | Mažeikiai | 135 | −987 | — | |
| 25 | Žemaitijos krašto draugija | Mažeikiai | 42 | 0 | — | |
| 26 | Mažeikių rajono kurčiųjų draugija | Mažeikiai | 0 | −100 | — | |
| 27 | Žemaitijos Montessori bendrija | Mažeikiai | 0 | 0 | — | |
| 28 | Šikšnosparnių apsaugos Lietuvoje draugija | Mažeikiai | 0 | −52 | — | |
| 29 | MAŽEIKIŲ RAJONO NEVYRIAUSYBINIŲ ORGANIZACIJŲ ASOCIACIJA | Mažeikiai | 0 | 0 | — | |
| 30 | Vaikų astmos klubas "Margaspalviai aitvarai" | Mažeikiai | 0 | 0 | — | |
| 31 | Mažeikių vartotojų asociacija | Mažeikiai | 0 | 0 | — | |
| 32 | Melioracijos sistemų naudotojų asociacija "Litdana" | Mažeikiai | 0 | −2 486 | — | |
| 33 | Žvejų klubas "Inkaras" | Mažeikiai | 0 | 0 | — | |
| 34 | Tautiečių Sąjunga "LIETUVA-MES" | Mažeikiai | 0 | 0 | — | — |
| 35 | Mažeikių "Diabeto IQ" klubas | Mažeikiai | 0 | 0 | — | — |
